Tretia komora je jednou zo štyroch komôr v mozgu, ktoré navzájom komunikujú. Rovnako ako v prípade ostatných mozgových komôr je naplnený mozgovomiechovým mokom, ktorý pomáha chrániť mozog pred poranením a transportovať živiny a odpad. Tretia komora je úzka dutina, ktorá sa nachádza medzi dvoma polovicami mozgu.
Tretia komora odosiela správy do a prijíma správy z bočných komôr, ktoré sú umiestnené pred treťou komorou, a vodovodu stredného mozgu, ktorý sa nachádza priamo za treťou komorou. Hypotalamus a talamus sú umiestnené po stranách tretej komory.
Abnormality tretej komory sú spojené s rôznymi stavmi vrátane hydrocefalu, meningitídy a ventrikulitídy. Hydrocefalus je nadmerné nahromadenie tekutiny v mozgu. Meningitída je zápal membrán pokrývajúcich mozog a miechu, zatiaľ čo ventrikulitída je zápalový stav komôr. Meningitída a ventrikulitída môžu byť spôsobené traumou komory, vrátane tretej komory, aj keď traumatická meningitída je zriedkavá.
Zväčšená tretia komora bola spojená s psychiatrickými chorobami, ako je schizofrénia; presnosť tejto teórie však nebola presvedčivo preukázaná.
