Mužský pohlavný systém sa skladá z vonkajšej a vnútornej časti. Medzi vonkajšie mužské genitálie patrí penis, močová trubica a miešok. Medzi vnútorné mužské pohlavné orgány patria semenný vačok, semenníky, vas deferens, epididymis, prostata, bulbouretrálna žľaza a ejakulačný kanál.
Penis je hlavnou súčasťou vonkajších mužských genitálií, ktoré majú sexuálne aj telesné funkcie. Je schopný ejakulovať spermu (obsahujúcu spermie) počas sexu a uvoľňovať z tela moč. Močová trubica prenáša moč z močového mechúra von z mužského tela. Semeno tiež cestuje cez močovú trubicu.
Každý muž má dve mieškové miešky, v ktorých sa nachádzajú určité časti vnútorných mužských genitálií (nadsemenníky, semenníky a dolné spermatické šnúry). Semenníky sú najdôležitejšou súčasťou vnútorných mužských genitálií, pretože vytvárajú a ukladajú spermie a dodávajú mužskému telu hormóny, ktoré riadia vývoj mužských vlastností a reprodukčných orgánov.
Nadsemenník ukladá, dozrieva a transportuje spermie medzi semenníkmi a vas deferens, ktoré vedú spermie smerom k močovej trubici. Semenné vezikuly susedia s močovou trubicou a vylučujú mliečnu tekutinu, ktorá sa nakoniec odvádza ejakulačným potrubím. Bulbourethrálne žľazy tiež pomáhajú pri vylučovaní spermy.